新疆地质局水文环境地质调查中心（简称“水环中心”）由原新疆地矿局第一水文工程地质大队（1957年成立）和第二水文工程地质大队（1978年成立）根据《自治区地勘事业单位改革实施方案》要求进行合并重组，于2024年5月25日宣布成立，为新疆地质局下属正处级公益一类事业单位。主要承担基础性、公益性水文地质、工程地质、环境地质、地质灾害防治、生态修复保护等调查工作。截至2025年2月，中心共有在编职工319人，其中专业技术人员199人，含正高级职称12人、副高级职称115人、中级职称58人、初级职称14人。水环中心坚持以习近平生态文明思想为指导，以推动新疆经济社会高质量发展为目标，聚焦自治区“十大产业集群”建设，主动服务自治区水资源勘查开发、生态文明建设、新型城镇化建设、乡村振兴战略，积极介入地热资源开发、水土资源调查、山水林田湖草沙综合治理、流域水土环境综合整治、特色农果业、水土污染治理、特色地质景观资源调查等领域，先后获省部级及行业级奖项共计两百余项，包括原国土资源部“全国地质勘查行业优秀地质找矿一等奖”、建设部“优秀勘察设计一等奖”、自治区国土资源科技进步一等奖等。近年来，累计完成各地州市水资源调查以及重要能源基地供水、整装勘查开发区供水和防病改水等水文地质勘查项目600余项，找到和评价大、中型水源地90余处。在塔县圈定并评价了全疆首个大型高温地热田，填补了全疆高温地热田的空白；陆续在温泉县、拜城县、乌恰县等地圈定地热田及地热靶区30余处，为新疆清洁能源勘查开发提供了详实依据。承担完成各类地质环境治理和地质灾害防治项目数百项，消除了灾害对近30万人的直接威胁，保护了数十亿元国家财产安全，为维护新疆社会稳定、人民安居乐业做出了显著贡献。